cara nya simpel gan, dengan memberi nilai true pada parameter ke empat fungsi mysql_connect,

saya akan memberikan contohnya sebagai berikut :

asumsikan, kedua database berada di host yang sama,kemudian kita ketikkan kode seperti ini :

<?php
//koneksi pertamax
$conn1 = mysql_connect($host, $user, $pass);
//koneksi kedua, dgn parameter true, yg berarti membuat koneksi baru 
$conn2 = mysql_connect($host, $user, $pass, true);

// pilih db pertama
mysql_select_db("nama_database1", $conn1);
// pelih db kedua
mysql_select_db("nama_database2", $conn2);

//query ke db pertama
mysql_query("SELECT * FROM nama_tabel", $conn1);

//query ke db kedua
mysql_query("SELECT * FROM nama_tabel", $conn2);
?>

Cukup Mudah BUkan... :)